Genjutsu sind Techniken, welche die fünf Sinne eines Menschen beeinflussen und verändern können. So kann mit einem Genjutsu zum Beispiel eine Illusion erschafft werden, oder aber auch ein Gegner einfach nur hypnotisiert werden. Nur wenige Ninja sind in der Lage, Genjutsu wirklich zu beherrschen, da es eine unglaubliche gute Kontrolle über das eigene Chakra erfordert. Bei Genjutsu wird dieses nämlich, durch die Luft transportiert, mit dem Chakra des Gegners verbunden und so dazu genutzt, um eine Illusion zu erschaffen.

Taijutsu sind körperliche Techniken, die meist auf bloßer physischer Kraft basieren und Schaden am Körper anrichten. Sie lassen sich in drei Gruppen einteilen: Physisch, Geschwindigkeit und Chakra. Beim ersten Typ wird einfach mit roher Kraft so lange auf den Gegner eingedroschen, bis dieser seinen Verletzungen erliegt. Der zweite Typ wird meist in Verbindung mit dem ersten oder dritten Typ eingesetzt, da er die Geschwindigkeit des Anwenders drastisch erhöht. Typ drei funktioniert mit Hilfe von Chakra. Dieses verstärkt die physische Kraft oder kann in den Körper des Gegners gesandt werden, um dort Schaden anzurichten.

Ninjutsu sind die Techniken, welche am häufigsten in Kämpfen benutzt werden, da ihre Kraft enorm ist. Sie machen sich die fünf Elemente zu Nutzen, indem diese durch das Chakra des Anwenders manipuliert und kontrolliert werden. Durch die natürliche Kraft, welche bei Ninjutsu eine Rolle spielt, sind sie jedoch auch manchmal für den Anwender selbst schwer zu kontrollieren. Auch Ninjutsu lassen sich in Gruppen einteilen: Elementare Techniken, Chakra Techniken und Kuchiyose Techniken. Typ eins bedient sich der Kraft der Elemente und hat eine unglaubliche Angriffskraft; Typ zwei funktioniert durch Chakra, welches in bestimmte Objekte oder Lebewesen gesandt wird, um diese zu manipulieren. Der dritte Typ, die Kuchiyose Techniken, dienen dazu, ein Lebewesen oder einen Gegenstand mithilfe des eigenen Chakras zu beschwören.

Doujutsu sind seltene Techniken und bisher sind nur drei bekannt - das Sharingan, das Byakugan und das Rinnegan. Sie sind allesamt Kekkei Genkai und dadurch nur innerhalb eines Clans zu erhalten, auch wenn es Ausnahmen geben kann. Doujutsu haben eine besondere Eigenschaft, die sie allen anderen Techniken in diesem Punkt überlegen macht, doch gibt es bei jeder Technik auch Nachteile. So kann man zwar mit dem Byakugan perfekt den Chakrafluss des Gegners sehen, jedoch hat man eine eingeschränkte Sicht.