Das Wappen des Uchiha-Clans
Sie wurden einst als der mächtigste Clan Konohas gefeiert. Ihre Spezialität liegt in Feuerjutsus. Ihr Sharingan, ein mächtiges Kekkei Genkai (Blutlinientechnik) gab ihnen vielerlei Vorteile gegenüber Feinden. Um als Erwachsener im Clan angesehen zu werden, muss man mindestens eine Feuertechnik beherrschen.
Es wird gesagt, dass einer ihrer Vorfahren die Konoha Militärpolizei gründete. Diese bestand fast nur aus Uchiha-Clan Mitgliedern. Momentan gibt es nur noch zwei bekannte Überlebende des Clans: Sasuke und Itachi. Itachi hat im Alter von 13 Jahren bei einem Massaker seine Familie und seine Verwandten niedergemetzelt. Er ließ nur seinen kleinen Bruder am Leben. Seine Begründung für dieses Massaker war, dass er seine Stärke testen wollte. Itachi weiß anscheinend auch ein düsteres Geheimnis um das Sharingan, das noch nicht bekannt ist.
Die typische Bekleidung der Uchihas ist das Logo auf dem Rücken. Die Kleidung ist meist sehr dunkel. Es gibt außerdem noch einen geheimen Treffpunkt des Clans, der sich unter der siebten Tatami-Matte auf der rechten Seite befinden. Dort liegt das Familiengeheimnis, eine Schriftrolle über das Mangekyou Sharingan.
Der Hyuuga Clan ist einer der mächtigsten, ältesten und neben den Uchihas einer der bedeutsamsten Clans in ganz Konoha; weil sie das Mächtige Kekkei Genkai Byakugan weitervererben. Der Clan besteht aus einer Gründer - und einer Zweigfamilie, die unter strikten Regeln voneinander Geschieden sind. Die Gründerfamilie trägt das Geheimnis der Byakugan, und um dieses zu wahren werden allen Kindern der Zweigfamilie im Alter von 4 Jahren ein Juin eingabrannt, was so viel " wie ein Vogel im Käfig gefangen " bedeutet. Die Gründerfamilie kann mit einem geheimen Fingerzeichen das Siegel aktivieren; welches anfängt die Nervenbahnen des Gehirns zu zerstören uns so einen höllischen, qualvollen Schmerz bereitet - und den Siegelträger somit jederzeit töten könnte. Die Mitglieder der Zweigfamilie Müssen die Mitglieder der Gründerfamilie mit allem, Notfalls sogar mit ihrem eigenen Leben beschützen und wenn erforderlich willenlos für sie sterben. Wenn ein Mitglied der Zweigfamilie zu zu Tode kommt, akktiviert sich ihr Juin ein letztes Mal und versiegelt das des Sterbenden für immer, und verhindert, dass es nie in fremde Hände gelangt.
Diese Regeln prägten die Vergangenheit von Neji, schwer, weil sein Vater,Hizashi Hyuuga, und Hinatas Vater, Hiashi Hyuuga, Zwillingsbrüder waren. Doch wurde Hizashi nur einige Sekunden später geboren, aber er war der jüngere und somit ein Mitglied der Zweigfamilie, während sein Bruder Stammhalter der Gründerfamilie wurde. Da die Kommunikation zwischen Gründerfamilie und Zweigfamilie praktisch nicht gegeben ist, schaffen es nur die Kinder des Haupthauses, das Byakugan vollständig einzusetzen und all seine Geheimnisse zu lernen. Deswegen blicken auch einigeder Gründerfamilie die Zweigfamilie hinab, da sie sie aufgrund dieser Tatsache als schwächer betrachten.
Ein tragischer Zwischenfall ereignete sich jedoch, als ein Ninja aus Kumogakure, welches erst kürzlich einen Friedensvertrag mit Konoha geschlossen hatte, Hinata, die junge Stammhalterin des Hyuuga-Clans entführen wollte um so an die Familiengeheimnisse der Byakugan zu kommen; jedoch konnte er von Hiashi getötet werden. Kumogakure, verärgert über den Mord ihres Eliteanführers, verlangte nun nach der toten Leiche von um den Mord auszugleichen - Ein Leben für ein Leben. Das wackelige Bündnis drohte zu kippen, um den Friedensvertrag dennoch zum Abschluss zu bringen, wollte Hiashi dem Verlangen von Kumogakure, nachgeben, um einen erneuten Krieg zu verhinden. Hizashi aber opferte sich an seiner Stelle, da er nicht die Gründerfamilie schützen wollte, wie es die Regeln des Hyuuga-Clans verlangen, sondern um seinen Bruder, sein Dorf und seinen geliebten Sohn Neji zu beschützen; für den das jedoch zu einem tiefen Trauma wurde. Er dachte, sein Vater wurde getötet, nur weil er in der Zweigfamilie war, und er kam zu der Ansicht, alles würde vom Schicksal bestimmt würde; und er hasste die Gründerfamilie bis zu jenem Tag, an dem Hiashi ihm die Wahrheit erzählte und Naruto ihm Klarstellte, dass man sein Schicksal und sich selbst verändern kann.
